2名首批返臺的兒童在上車前消毒雙手。（臺北家長會長協會提供）
武漢包機返臺，最終以大陸航空公司用春節加班機的模式返臺，而非華航派機去接人，這當中也暗含兩岸角力。因爲若讓臺灣派飛機去接人，猶如「撤僑」，在兩岸政治定位曖昧不明的此時，大陸若答應會有政治風險，而加班機模式則相對中性，又恰好在春節期間，經過雙方和臺商協會的斡旋努力，在短短几天促成了包機返臺。
一名武漢資深臺商直言，大陸要面子，如果同意臺灣派飛機接人，形同「撤僑」，對大陸來說會臉上無光，這隻說對了一半，另一部分考量的，就是兩岸政治定位。因爲對大陸而言，兩岸絕不可以是國際關係，然而「撤僑」這個動作又有外交象徵意義，如果循撤僑模式，大陸恐不只臉上無光，還犯了政治錯誤。
就像是幾年前在討論臺灣人在大陸享有「國民待遇」，最後被正名爲「同等待遇」或「居民待遇」，就是因爲「國民待遇」一詞，指的是外國人。
疫情當前，照理說都該把防疫擺在第一位，政治其次，但兩岸關係實在太敏感，尤其在近期政治氛圍下，雙方即便口頭上不說，但在操作上一定都會考量。
譬如臺灣在防疫同時，也順勢呼籲WHO要邀請臺灣參加，不能讓臺灣成爲防疫孤兒，並藉此批評大陸在國際上對臺灣的打壓，還衍生出藝人范瑋琪的狗官事件爭論，這當中都不脫兩岸關係元素。
而大陸爲了防止臺灣炒作，官媒昨特別訪問了WHO相關人士，指WHO一直通過《國際衛生條例》有關渠道與臺當局保持溝通；大陸外交部昨還稱，臺灣能及時獲取WHO發佈的全球突發公共衛生事件信息，當然也不忘重申臺灣若要參與「必須在一中原則下通過兩岸協商做出合情合理安排」。
北京聯合大學臺研院副院長李振廣受訪直言，兩岸很多人政治神經過於敏感，也反映當前兩岸民衆「集體情緒的躁動」，已經惡化到很不好的地步；他認爲在這個節骨眼，應該着重在怎麼把事情解決，防疫優先，少一點政治，他也直言，包機不管是大陸派機或臺灣派機，都是包機，重點是讓在武漢的臺灣民衆能平安返臺，纔是最重要的。